Polpharma zajęła 4. miejsce wśród najbardziej innowacyjnych firm w Polsce w rankingu za rok 2008 przeprowadzonym przez Instytut Nauk Ekonomicznych PAN.
Dwa leki Polpharmy Asmenol i Polocard zostały wyróżnione w plebiscycie „Launch roku 2009”, organizowanym przez firmę Cooper Conferences. Asmenol został uznany za Launch roku 2009 w kategorii leków Rx, a Polocard w kategorii leków OTC.