Działalność Polpharmy spotyka się z uznaniem środowisk medycznych, biznesowych i mediów. Dowodem są liczne nagrody przyznane firmie i jej produktom.
Marka Polpharma została uznana za jedną z najsilniejszych marek biznesowych w polskiej edycji konkursu Business Superbrands.
Za udział w rozwój kardiologii w Polsce Polpharma otrzymała najważniejsze wyróżnienie Polskiego Towarzystwa Kardiologicznego - trzykrotny tytuł Partnera Polskiej Kardiologii oraz trzykrotny tytuł Przyjaciela Polskiej Kardiologii.
Produkty firmy cieszą się zaufaniem pacjentów, co potwierdza zarówno ich silna pozycja rynkowa, jak i otrzymane nagrody: Złoty Otis, Laur Konsumenta czy Produkt Roku.