Działania POLPHARMY na rzecz ekologii obejmują między innymi:
Polpharma realizuje Politykę Ochrony Środowiska, Politykę "Zielona Chemia" oraz przestrzega wszystkich wymagań prawa polskiego i europejskiego w tej dziedzinie. Posiada także wszystkie niezbędne pozwolenia ekologiczne, w tym najważniejsze - tzw. „Pozwolenie zintegrowane”, oparte na Dyrektywie IPPC w sprawie zintegrowanego zapobiegania i ograniczania zanieczyszczeń.
Wpisując troskę o ludzi i środowisko w swoją strategię działania, Polpharma wdrożyła Zintegrowany System Zarządzania Środowiskowego i BHP. Zgodność tego systemu z międzynarodowymi normami potwierdziły certyfikaty ISO 14001 (ochrona środowiska), a także certyfikaty OHSAS 18001 i PN-N-18001 (BHP).
Norma ISO 14001 została stworzona przez International Organization for Standardization (ISO) i bazuje na trzech pojęciach: ciągłego doskonalenia, zapobiegania zanieczyszczeniom i zgodności z wymaganiami prawnymi. Firma działająca zgodnie z ISO musi zidentyfikować wszystkie wpływy na środowisko wraz z wywołującymi je aspektami, a następnie podjąć działania doskonalące w krytycznych obszarach.
Od 2007 roku Polpharma wydaje raporty środowiskowe, pokazujące wpływ firmy na środowisko na przestrzeni lat oraz działania firmy w celu jego ograniczania.
Polpharma wprowadza również zmiany zmierzające do eliminacji zagrożeń w środowisku pracy. W tym celu wdrożyła i realizuje Politykę Bezpieczeństwa i Higieny Pracy. W ostatnich latach stopniowo usuwano z procesów technologicznych substancje niebezpieczne, m.in. benzen, fosgen, cyjanek sodu, rtęć, które mogły niekorzystnie wpływać na stan zdrowia pracowników. Na ograniczenie czynników szkodliwych i niebezpiecznych w procesach pracy wpływa ponadto redukcja produkcji wielkotonażowej, a także automatyzacja wytwarzania, magazynowania i działalności pomocniczej.