Działania Polpharmy na rzecz ekologii obejmują między innymi:
Polpharma realizuje Politykę Zrównoważonego Rozwoju oraz przestrzega wszystkich wymagań prawa polskiego i europejskiego w tej dziedzinie. Posiada także wszystkie niezbędne pozwolenia ekologiczne, w tym najważniejsze - tzw. „Pozwolenie zintegrowane”, oparte na Dyrektywie IPPC w sprawie zintegrowanego zapobiegania i ograniczania zanieczyszczeń.
Wpisując troskę o ludzi i środowisko w swoją strategię działania, Polpharma wdrożyła Zintegrowany System Zarządzania Środowiskowego i BHP. Zgodność tego systemu z międzynarodowymi normami potwierdziły certyfikaty ISO 14001 (ochrona środowiska), a także certyfikaty OHSAS 18001 i PN-N-18001 (BHP).
Norma ISO 14001 została stworzona przez International Organization for Standardization (ISO) i bazuje na trzech pojęciach: ciągłego doskonalenia, zapobiegania zanieczyszczeniom i zgodności z wymaganiami prawnymi. Firma działająca zgodnie z ISO musi zidentyfikować wszystkie wpływy na środowisko wraz z wywołującymi je aspektami, a następnie podjąć działania doskonalące w krytycznych obszarach.
Od 2007 roku Polpharma wydaje raporty środowiskowe, pokazujące wpływ firmy na środowisko na przestrzeni lat oraz działania firmy w celu jego ograniczania.